Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccbe1Q3MI99 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccbe1Q3MI99 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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