Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdss1Q33DR2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms