Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms