Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna5Q2MKA5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms