Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms