Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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