Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms