Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli2Q0VGT2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms