Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms