Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Plac8l1Q08EJ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms