Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700061G19RikQ08EE8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms