Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q08AU9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q08AU9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q08AU9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q08AU9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q08AU9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q08AU9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms