Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou6f1Q07916 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms