Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ebf1Q07802 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebf1Q07802 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms