Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col17a1Q07563 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col17a1Q07563 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms