Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AmbpQ07456 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms