Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gdf3Q07104 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gdf3Q07104 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms