Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPINDOCQ05AH6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPINDOCQ05AH6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms