Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcn1Q05186 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcn1Q05186 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms