Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk18Q04899 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk18Q04899 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms