Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scg2Q03517 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scg2Q03517 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms