Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms