Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hivep1Q03172 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hivep1Q03172 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms