Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GscQ02591 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GscQ02591 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GscQ02591 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GscQ02591 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms