Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnb1Q02248 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms