Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkcqQ02111 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcqQ02111 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms