Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snai1Q02085 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snai1Q02085 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms