Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SelpQ01102 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms