Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms