Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp1Q00915 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbp1Q00915 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms