Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfaQ00731 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms