Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rbp4Q00724 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms