Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms