Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms