Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gbp10Q000W5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbp10Q000W5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms