Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Brca2P97929 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brca2P97929 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Brca2P97929 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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