Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smn1P97801 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms