Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cry1P97784 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cry1P97784 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms