Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bop1P97452 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms