Protein–RNA interactions for Protein: P97346

Nxn, Nucleoredoxin, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NxnP97346 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NxnP97346 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NxnP97346 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NxnP97346 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NxnP97346 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NxnP97346 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms