Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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