Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Arf1P84078 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms