Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irx1P81068 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx1P81068 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irx1P81068 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Irx1P81068 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Irx1P81068 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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