Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CiitaP79621 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CiitaP79621 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms