Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Polr1bP70700 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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