Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shox2P70390 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shox2P70390 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shox2P70390 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shox2P70390 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shox2P70390 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shox2P70390 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shox2P70390 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shox2P70390 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shox2P70390 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shox2P70390 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Shox2P70390 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shox2P70390 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shox2P70390 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shox2P70390 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shox2P70390 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms