Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms