Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad1P70340 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad1P70340 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms