Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb13P70321 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms