Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms